Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms