Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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