Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS2Q9NRF8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms