Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms