Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR6Q9HBX8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR6Q9HBX8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR6Q9HBX8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR6Q9HBX8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR6Q9HBX8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms