Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms