Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms