Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms