Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR88Q9GZN0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms