Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms