Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms