Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms