Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms