Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms