Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGIP1Q9BQI5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms