Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNS3Q9BQ31 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms