Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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