Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLIN4Q96Q06 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms