Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP3Q96P20 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms