Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms