Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms