Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms