Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTP4Q96DX8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTP4Q96DX8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms