Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms