Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP9XQ93008 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP9XQ93008 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP9XQ93008 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP9XQ93008 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP9XQ93008 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms