Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF1Q92879 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF1Q92879 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms