Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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