Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C11orf40Q8WZ69 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C11orf40Q8WZ69 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C11orf40Q8WZ69 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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C11orf40Q8WZ69 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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C11orf40Q8WZ69 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C11orf40Q8WZ69 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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