Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms