Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms