Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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