Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms