Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms