Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms