Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms