Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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