Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms