Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC9Q6ZRR7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms