Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A10Q6U841 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms