Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms