Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms