Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECM29Q5VYK3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECM29Q5VYK3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms