Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms