Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms