Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM69BQ5VUD6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms