Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms