Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms