Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms