Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms