Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf46Q504U0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf46Q504U0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf46Q504U0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf46Q504U0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf46Q504U0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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C4orf46Q504U0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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C4orf46Q504U0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf46Q504U0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf46Q504U0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf46Q504U0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf46Q504U0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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